La situation des chrétiens est très différente suivant leur lieu de vie dans le pays.
En tant que seul pays majoritairement chrétien en Asie du Sud-Est, de nombreux chrétiens, en particulier les catholiques de Luzon et des Visayas, bénéficient d'un haut niveau de liberté religieuse. Cela contraste fortement avec la situation des chrétiens vivant dans la région autonome de Bangsamoro en Mindanao musulman (BARMM) et de ceux qui soutiennent les communautés les plus marginalisées et protègent l'environnement sur la base de convictions chrétiennes.
Les convertis issus de religions tribales ou de l'islam sont également confrontés à des défis et sont souvent soumis à une forte pression pour retourner à leur foi d'origine. La BARMM est en phase de transition pour intégrer un système de tri-justice qui incorpore la Constitution des Philippines, la charia et les lois traditionnelles ou tribales, avec des efforts en cours pour étendre et renforcer les systèmes juridiques de la charia dans le cadre de l'agenda de réforme de la justice de la BARMM.
